El decreto firmado por el presidente López Obrador, que en breve será publicado en el Diario Oficial de la Federación (DOF), detalla las funciones de la comisión presidencial, entre las que destaca la realización de labores de investigación documental, de campo, trabajos técnicos e informativos que ayuden a esclarecer la situación jurídica y social que guardan las tierras, el territorio y el agua del pueblo yaqui, así como las condiciones de desarrollo de las comunidades que lo integran.
Asimismo, plantea solicitar información a las dependencias y entidades que correspondan en los tres órdenes de gobierno; generar propuestas que sirvan como base para la toma de decisiones que garanticen justicia al pueblo yaqui; coordinar acciones de planeación, implementación y evaluación participativa para el desarrollo integral; así como mantener el diálogo y la interlocución permanentes con las comunidades.
Del mismo modo, establece que la comisión presidencial desarrollará sus funciones mediante sesiones en la Guardia Tradicional (sede del gobierno tradicional de las comunidades yaquis), que se llevarán a cabo de acuerdo con las normas y procedimientos de sus sistemas normativos.